据了解，2008年4月17日，深圳市规划和国土资源委员会（原深圳市国土资源和房产管理局，以下简称市规土委）在《深圳特区报》刊登了该工程项目的《房屋拆迁通告》。整个枢纽工程项目共涉及385户被拆迁人，拆迁建筑总面积共计133126.98平方米。截止目前，已完成362户拆迁工作，占被拆迁户数的94.03%。对少数未签约的拆迁户业主，龙岗区政府和布吉街道办、拆迁办、地铁3号线投资公司等单位，多次组织拆迁工作人员，采取面对面商谈，逐户上门做工作等形式，反复听取意见，耐心宣传解释拆迁政策。但由于部分业主坚持要求按高于市场评估价的标准对房屋进行补偿，或不符合安置条件的要求进行安置，拒不签订拆迁补偿协议，造成枢纽工程建设工期滞后，进而影响工程整体施工进度，严重防碍了公共利益实现。
为了确保工程能够顺利进行，为大运会召开提供便捷的交通保障，拆迁人地铁3号线有限公司根据《城市房屋拆迁管理条例》和《深圳市公共基础设施建设项目房屋拆迁管理办法》等相关规定，已分批对剩余未签约的被拆迁人向房屋拆迁主管部门即市规土委提起行政裁决申请。其中通过市规土委召开调查举证及调解会议，部分被申请人已经于会后与拆迁人达成了拆迁补偿安置协议，从而推进拆迁工作进程。由于极少数被拆迁人拒不签订拆迁补偿安置协议，市规土委根据国务院颁布的《城市房屋拆迁管理条例》、《城市房屋拆迁行政裁决工作规程》及《深圳市公共基础设施建设项目房屋拆迁管理办法》等相关规定，依法下达了《房屋拆迁补偿裁决书》，于今年7月28日和8月13日送达拆迁人与被拆迁人，并业已生效。但被拆迁人未在裁决书规定的搬迁期限（20天）内搬迁。9月4日，市规土委邀请了市法制办、区人大代表、区政协委员、区信访办等部门代表在龙岗分局召开拟申请行政强制拆迁听证会。会上对行政强制拆迁的依据、程序、补偿安置标准的测算依据等内容进行听证。
听证会后，拆迁人与被拆迁人继续进行协商，由于被拆迁人坚持其超越法规政策规定的不合理补偿要求，双方仍无法达成拆迁补偿协议。鉴此，拆迁人已将应支付给被拆迁人的拆迁补偿款提存至深圳市龙岗区公证处，被拆迁人可以凭借其身份证等有效证件到龙岗区公证处领取相应的拆迁补偿款；同时，拆迁人还向龙岗区公证处提起房屋拆迁证据保全公证申请。
由于个别被拆迁人拒不搬迁，严重影响布吉客运枢纽工程如期竣工。市规土委依法向深圳市龙岗区政府申请行政强制拆迁。受理申请后，龙岗区政府依法进行了审查，并于11月6日依法作出了《行政强制拆迁决定书》，于11月12日送达被拆迁人，要求被拆迁人在决定书送达之日起15日内（即在11月27日前）自行搬离涉案房屋，否则将责成相关部门实施强制拆迁。此后，经过反复沟通，有1户被拆迁人已签订拆迁补偿安置协议，还有3栋建筑业主仍未按期搬离。
由于这3栋楼的位置处于该工程项目亟待进行施工的布吉河框架涵所急需的场地，如果不及时拆迁，将严重影响整个项目工程的进度。为了使布吉客运枢纽工程顺利进行，推进城市建设发展，12月17日，龙岗区政府组织区有关部门和布吉街道办事处依法依规对3栋建筑实施强制拆除。至当日下午，3栋建筑被拆除完毕。目前，龙岗区各有关部门和布吉街道办事处正在做好后续工作。
布吉客运枢纽工程是地铁3号线、5号线、广深铁路等多条轨道交通的换乘站，是深圳市重大公共基础设施建设工程。工程占地面积为12.8万㎡，工程总概算约10.1亿元，目前已开工，计划2011年6月底建成。该工程项目建设对于完善城市功能配套，缓解布吉片区道路交通压力，推动区域经济社会发展及特区内外一体化，都具有十分重大的意义。在工程施工前的拆迁过程中，绝大部分业主都能从维护公共利益出发，理解、支持和配合工程建设，合理合法地与拆迁人达成拆迁补偿协议，以实际行动支持市政重大工程建设和建设新布吉及迎接2011年世界大学生运动会。
